La Diócesis del Tucumán fue erigida en 1570 con sede en Santiago del Estero. En 1597 el obispo Fray Fernando de Trejo y Sanabria decreta la creación de un Seminario Conciliar en Madrid de las Juntas, el primero en suelo argentino; debido a las dificultades propias de aquellos tiempos, este Seminario decayó y fue nuevamente erigido por el mismo obispo, el 16 de diciembre de 1611 en la ciudad de Santiago del Estero. En 1699, el obispo Mercadillo traslada la sede de la diócesis del Tucumán a la ciudad de Córdoba, y con ella el Seminario conciliar “porque en toda esta gobernación no hay lugar más a propósito para ello que esta ciudad de Córdoba, por muchos conceptos”.
Por entonces, los seminaristas realizaban sus estudios preparatorios en el mismo Seminario, y luego cursaban filosofía, derecho y teología en la Universidad de San Carlos, originalmente llamada Colegio Máximo de los jesuitas, fundado en Córdoba en 1613, y erigido como Universidad en 1622. En estos años el Colegio Seminario de Loreto funcionaba como un colegio mayor de la Universidad. La misma era frecuentada por dos grupos de alumnos: el primero, constituido por quienes aspiraban al Doctorado en Teología y, en general, también al sacerdocio; el segundo, integrado por aquéllos que por afán personal de instrucción, aspirando a grados académicos inferiores, elegían la formación moral, intelectual y religiosa impartida por la Universidad.
En 1767 se ejecuta en Córdoba la expulsión de los jesuitas, y la Universidad queda a cargo de los franciscanos; más tarde es encargada al clero secular. El 1 de diciembre de 1800 Carlos IV fundó la Real Universidad de San Carlos y Nuestra Señora de Monserrat, la que, ya en los tiempos de la independencia nacional, pasó inicialmente a la provincia y luego, el 29 de mayo de 1854, fue nacionalizada.
La segunda mitad del siglo XIX fue testigo de crecientes tensiones entre el Seminario Conciliar y la Universidad. Para el obispo diocesano las aulas universitarias eran cada vez menos adecuadas para los seminaristas debido a los aires liberales que soplaban en sus cátedras. Por este motivo se solicitó que las clases de Filosofía y Teología se dictaran en el mismo Seminario; finalizados los estudios y dados los exámenes los seminaristas podían obtener grados académicos en la Universidad, aun repitiendo los exámenes si fuera necesario. El 16 de enero de 1881, el obispo Fray Mamerto Esquiú hizo un nuevo intento de recuperar la enseñanza de la Teología en la Universidad. Sin embargo, el entredicho acerca de cuál debía ser la autoridad responsable del nombramiento de los profesores, si el Rector o el Arzobispo, condujo a un callejón sin salida.
En cuanto a la formación académica de los futuros sacerdotes, durante el siglo XX el Seminario Mayor Nuestra Señora de Loreto se consolidó como casa de altos estudios en Filosofía y Teología; algunos de sus más célebres docentes impartieron clases de diversas disciplinas en la Universidad Nacional de Córdoba, donde se abrió por algunas décadas la carrera de Licenciatura en Ciencias Religiosas. En la primera mitad de aquel siglo el claustro docente del Seminario, formado fundamentalmente en Roma, Francia y Alemania, realizó publicaciones de carácter científico y se instaló como un referente en la discusión académica cordobesa. El anhelo de constituir una Facultad de Teología en la ciudad de Córdoba cobró nuevo impulso en 1959; por ello, se inició un diálogo con la Facultad de Teología de Buenos Aires que fructificó en el acuerdo y vinculación a dicha Facultad a partir del Decreto de Afiliación, emitido por la Sagrada Congregación de Seminarios y Universidades el 14 de junio de 1961.
En 1968, la Arquidiócesis de Córdoba, siguiendo los impulsos del Concilio Ecuménico Vaticano II, creó el Studium Theologicum de Córdoba tendiente a la concentración de fuerzas y a la mutua colaboración en la tarea formativa, asumiendo el modelo eclesiológico delineado por el Magisterio universal y latinoamericano. Además de incluir a los seminaristas de las distintas diócesis de Córdoba y de Cuyo – cuyos seminaristas eran enviados al Seminario Nuestra Señora de Loreto – incorporó a los estudiantes religiosos salesianos (Villada), redentoristas (San Alfonso) y claretianos (Villa Claret). Dificultades posteriores llevaron a que esta experiencia durara sólo hasta diciembre de 1972. Aunque la iniciativa de unificación de los estudios teológicos en Córdoba no dio todos los frutos esperados, el Studium Theologicum sostuvo y fortaleció su vínculo con la Facultad de Teología de la Pontificia Universidad Católica Argentina. Esto queda documentado en las consecutivas solicitudes de renovación de la Afiliación a la Facultad de Teología de la Pontificia Universidad Católica Argentina. Desde 1991, el trayecto de los cuatro primeros años de los estudios del Seminario obtuvo la acreditación y reconocimiento civil como Profesorado en Ciencias Sagradas, originándose el Instituto Nuestra Señora de Loreto. Y en estos últimos años, en el marco del camino pastoral que la Arquidiócesis, se han dado instancias nuevas de comunión y cooperación; entre ellas, la colaboración en red de los institutos de Ciencias Sagradas (profesorados) ya existentes en Córdoba en orden a fortalecer la misión de una renovada formación teológica para todo el Pueblo de Dios. Así surgió el actual ITeC (Instituto Teológico de Córdoba).